النسخ المشهورة التی وقفت علیها و التی ذکرت أصولها ترجع الی احدی الامهات الآتیة، و قد اعتمدت علی النسخة التی بخط غلام علی الشهیر بمحمد أمین ابن محمد علی، التی کتبها فی عاشر ذیالحجة 1079 ه حیث جمعت نصوص کلمات النساخ قبله حتی عصر ابن السکون (کان حیا 600) و اهتم اهتماما بلیغا بضبط کل ما وجده فی نسخة الشهید (ت 782) برموز خاصة و ان خفی علی بعضها، و الشهید کتب نسخته فی شعبان سنة 772 ه عن نسخة علی بن أحمد السدید، و السدید کتب نسخته عن نسخة أبیالحسن علی بن محمد بن السکون (کان حیا سنة 600) و قد جاء بخط محمد أمین ما نصه:
«نقلت هذه الصحیفة الکاملة الغریة المنسوبة الی سیدنا و مولانا السجاد و زین العباد الامام المفترض الطاعة علی بن الحسین بن علی بن أبیطالب صلوات الله و سلامه علیهم، من خط الشیخ العالم العلامة الشهید الاول شمسالدین محمد بن مکی رحمه الله تعالی و رضی عنه، و تتبع أعاریبها و نقطها و جمیع ما یری فیها من الحواشی و النسخ لفظا باللفظ عن أقصاه، حسب الجهد و الطاقة الا ما زاغ عنه نظری و حسر عنه بصری، و کان ذلک فی عاشر ذیالحجة سنة تسع و سبعین بعد الالف، و أنا العبد المفتقر الی عفو ربه العلی، ابنمحمد علی غلام علی الشهیر بمحمد أمین».